Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PBRM1Q86U86 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PBRM1Q86U86 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms