Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
STRCQ7RTU9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
STRCQ7RTU9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms