Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBR3Q6ZT12 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR3Q6ZT12 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms