Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP1R3FQ6ZSY5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms