Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCD1Q6ZMY3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms