Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms