Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC3LQ5T215 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms