Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FRMPD1Q5SYB0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms