Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP188Q5SRE5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms