Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP221Q4G0U5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms