Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX19Q49B96 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX19Q49B96 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms