Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP100Q494V2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP100Q494V2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
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