Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF3Q3KNV8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms