Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

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Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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LRRC36Q1X8D7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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LRRC36Q1X8D7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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LRRC36Q1X8D7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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LRRC36Q1X8D7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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LRRC36Q1X8D7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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LRRC36Q1X8D7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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LRRC36Q1X8D7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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LRRC36Q1X8D7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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LRRC36Q1X8D7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC36Q1X8D7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms