Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q1T7F1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q1T7F1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q1T7F1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q1T7F1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q1T7F1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q1T7F1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q1T7F1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q1T7F1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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