Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLPPQ16740 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLPPQ16740 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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