Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCBQ16585 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCBQ16585 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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