Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDB1Q16531 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DDB1Q16531 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDB1Q16531 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
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