Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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VAMP3Q15836 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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VAMP3Q15836 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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VAMP3Q15836 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP3Q15836 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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VAMP3Q15836 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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VAMP3Q15836 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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VAMP3Q15836 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VAMP3Q15836 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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