Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA2Q15822 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA2Q15822 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms