Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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