Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.371e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.311e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.31e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.181e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.081e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.041e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 BCL7B-211ENST00000486818 1404 ntTSL 515.31■□□□□ 0.041e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 BCL7B-213ENST00000493671 1802 ntTSL 215.28■□□□□ 0.041e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.011e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.041e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AP1M1-215ENST00000592703 583 ntTSL 214.7□□□□□ -0.061e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.081e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.081e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.111e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.121e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.131e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.261e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 BCL7B-210ENST00000482231 1638 ntTSL 212.99□□□□□ -0.331e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AFMID-208ENST00000588800 647 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AP1M1-205ENST00000586543 642 ntTSL 512.43□□□□□ -0.421e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AFMID-207ENST00000588199 778 ntTSL 512.13□□□□□ -0.471e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AFMID-211ENST00000589664 754 ntTSL 512.04□□□□□ -0.481e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AFMID-206ENST00000587750 541 ntTSL 312.01□□□□□ -0.491e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AFMID-202ENST00000409257 1730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AFMID-203ENST00000585419 493 ntTSL 310.84□□□□□ -0.671e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AFMID-214ENST00000591952 582 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.781e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.261e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 CLCN7-208ENST00000564968 652 ntTSL 417.66■□□□□ 0.423e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.798e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 S100A11-202ENST00000478109 557 ntTSL 35.27□□□□□ -1.578e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 CHCHD10-205ENST00000523865 490 ntTSL 29.07□□□□□ -0.961e-8■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 POLR2E-203ENST00000586215 756 ntTSL 216.41■□□□□ 0.225e-13■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 TMEM259-210ENST00000592618 1877 ntTSL 526.49■■□□□ 1.834e-16■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.243e-12■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.933e-12■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.733e-12■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 TMEM259-211ENST00000593068 1965 ntTSL 519.04■□□□□ 0.643e-12■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 TMEM259-205ENST00000586704 2538 ntTSL 518.59■□□□□ 0.573e-12■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 PDCD6IP-208ENST00000465122 894 ntTSL 35.64□□□□□ -1.511e-6■■■■□ 19.4
PCBP1Q15365 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.926e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.711e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.651e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.451e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 SLC35B2-203ENST00000495706 1859 ntTSL 324.09■■□□□ 1.451e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 TMEM198-203ENST00000421791 1057 ntTSL 223.4■■□□□ 1.341e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.261e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 222.63■■□□□ 1.212e-10■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 SREBF1-216ENST00000490796 698 ntTSL 221.96■■□□□ 1.114e-15■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.061e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MYO18A-208ENST00000530557 1118 ntTSL 521.21■□□□□ 0.991e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.911e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.891e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 BCL2L2-204ENST00000556599 548 ntTSL 320.4■□□□□ 0.861e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MMP11-204ENST00000437086 2071 ntTSL 220.31■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 CAPN15-203ENST00000565010 1952 ntTSL 1 (best)19.99■□□□□ 0.798e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 419.73■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.711e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PDE3B-205ENST00000534317 5521 ntTSL 1 (best)18.87■□□□□ 0.611e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 ATXN1L-203ENST00000569119 428 ntTSL 518.83■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 ZNF358-201ENST00000596712 662 ntTSL 318.46■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 NACC1-202ENST00000585663 615 ntTSL 518.04■□□□□ 0.482e-12■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MED15-217ENST00000445987 590 ntTSL 417.84■□□□□ 0.451e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 IST1-225ENST00000568581 503 ntTSL 516.63■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 RNPEPL1-203ENST00000451363 538 ntTSL 416.58■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MYO18A-217ENST00000533652 542 ntTSL 516.31■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 GTPBP1-203ENST00000458073 1350 ntTSL 516.19■□□□□ 0.182e-12■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 RNPEPL1-208ENST00000486058 3126 ntTSL 215.77■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 SREBF1-207ENST00000447641 644 ntTSL 315.64■□□□□ 0.094e-15■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 GTPBP1-210ENST00000484971 582 ntTSL 315.59■□□□□ 0.092e-12■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 CAPN15-204ENST00000566977 279 ntTSL 515.18■□□□□ 0.028e-7■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.012e-12■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -01e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 CYB5R3-207ENST00000466276 581 ntTSL 414.83□□□□□ -0.041e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 SREBF1-223ENST00000584760 564 ntTSL 214.77□□□□□ -0.054e-15■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLSCR4-208ENST00000476202 814 ntTSL 514.56□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.111e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 CYB5R3-206ENST00000438270 675 ntTSL 313.34□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MMP11-206ENST00000465385 3823 ntTSL 213.33□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLSCR4-202ENST00000383083 3033 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 MYO18A-207ENST00000530254 6479 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 C2orf72-203ENST00000477463 579 ntTSL 413.19□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLSCR4-205ENST00000460350 1054 ntTSL 513.13□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 AC008878.1-201ENST00000597384 634 ntTSL 312.33□□□□□ -0.441e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.441e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 GRN-216ENST00000589923 437 ntTSL 212.06□□□□□ -0.481e-6■■■■□ 19.3
PCBP1Q15365 FOSL2-202ENST00000379619 5829 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 19.3
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 162 ms