Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HDM1Q15032 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
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