Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
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