Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPSQ13938 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPSQ13938 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms