Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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