Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GPM6BQ13491 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPM6BQ13491 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPM6BQ13491 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPM6BQ13491 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPM6BQ13491 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPM6BQ13491 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPM6BQ13491 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPM6BQ13491 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPM6BQ13491 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPM6BQ13491 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPM6BQ13491 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPM6BQ13491 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms