Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIGQ13278 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIGQ13278 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIGQ13278 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIGQ13278 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIGQ13278 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIGQ13278 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIGQ13278 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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