Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PDZK1IP1Q13113 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PDZK1IP1Q13113 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PDZK1IP1Q13113 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PDZK1IP1Q13113 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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