Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MYO1EQ12965 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYO1EQ12965 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms