Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIAQ12857 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIAQ12857 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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