Protein–RNA interactions for Protein: Q12303

YPS3, Aspartic proteinase yapsin-3, yeastyeast

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS3Q12303 PTC5YOR090C 1719 nt1.67□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 CDC50YCR094W 1176 nt1.67□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.67□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 VTC1YER072W 390 nt1.67□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.67□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 URM1YIL008W 300 nt1.67□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 YKL136WYKL136W 399 nt1.67□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 YOR105WYOR105W 327 nt1.67□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.67□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 IST2YBR086C 2841 nt1.67□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 VPS52YDR484W 1926 nt1.67□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 MET18YIL128W 3099 nt1.67□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 YDL041WYDL041W 354 nt1.66□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.66□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.66□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 YKL118WYKL118W 312 nt1.66□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 YLR031WYLR031W 561 nt1.66□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 CCW14YLR390W-A 717 nt1.66□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 FMP23YBR047W 528 nt1.66□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 YPL238CYPL238C 390 nt1.66□□□□□ -2.14
YPS3Q12303 YJL016WYJL016W 1686 nt1.65□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 VPH1YOR270C 2523 nt1.65□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YLR458WYLR458W 381 nt1.65□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.65□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 NAN1YPL126W 2691 nt1.65□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 GCN2YDR283C 4980 nt1.65□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 BRO1YPL084W 2535 nt1.65□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 TRL1YJL087C 2484 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YJR003CYJR003C 1560 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YSW1YBR148W 1830 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 SWT1YOR166C 1377 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YDL152WYDL152W 366 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 WIP1YDR374W-A 270 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YHL037CYHL037C 402 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 RPL40AYIL148W 387 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 LSM7YNL147W 348 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 TIM18YOR297C 579 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 MGR1YCL044C 1254 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 IPT1YDR072C 1584 nt1.64□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YDR413CYDR413C 576 nt1.63□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YER097WYER097W 330 nt1.63□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 SNC1YAL030W 354 nt1.63□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YMR324CYMR324C 243 nt1.63□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YOR333CYOR333C 417 nt1.63□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 ROX1YPR065W 1107 nt1.63□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 RTT107YHR154W 3213 nt1.63□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 NCL1YBL024W 2055 nt1.63□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 VPS8YAL002W 3825 nt1.63□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 RTT101YJL047C 2529 nt1.63□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.62□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YDR008CYDR008C 351 nt1.62□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YDR102CYDR102C 333 nt1.62□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 BRP1YGL007W 378 nt1.62□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.62□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 NOP10YHR072W-A 177 nt1.62□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.62□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 MSL1YIR009W 336 nt1.62□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YAR053WYAR053W 297 nt1.62□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 RPL26AYLR344W 384 nt1.62□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.62□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 IRC10YOL015W 1761 nt1.62□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 snR79snR79 84 nt1.61□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 TMA22YJR014W 597 nt1.61□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.61□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 CDC24YAL041W 2565 nt1.61□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 CDC53YDL132W 2448 nt1.61□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 GYP5YPL249C 2685 nt1.61□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 MNE1YOR350C 1992 nt1.6□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 CAJ1YER048C 1176 nt1.6□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 MAM33YIL070C 801 nt1.6□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.6□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 TMA7YLR262C-A 195 nt1.6□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 PGA1YNL158W 597 nt1.6□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YPR146CYPR146C 330 nt1.6□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 MSS11YMR164C 2277 nt1.6□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 BFA1YJR053W 1725 nt1.6□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 CHC1YGL206C 4962 nt1.59□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 SET2YJL168C 2202 nt1.59□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 PCF11YDR228C 1881 nt1.59□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YDR366CYDR366C 399 nt1.59□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 YFL032WYFL032W 321 nt1.59□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 HOP2YGL033W 657 nt1.59□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 IRC20YLR247C 4671 nt1.59□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 PDR8YLR266C 2106 nt1.59□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 ISF1YMR081C 1017 nt1.59□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 HCH1YNL281W 462 nt1.59□□□□□ -2.15
YPS3Q12303 PUT3YKL015W 2940 nt1.59□□□□□ -2.16
YPS3Q12303 MGA2YIR033W 3342 nt1.58□□□□□ -2.16
YPS3Q12303 SIR4YDR227W 4077 nt1.58□□□□□ -2.16
YPS3Q12303 YCR022CYCR022C 345 nt1.58□□□□□ -2.16
YPS3Q12303 YER121WYER121W 345 nt1.58□□□□□ -2.16
YPS3Q12303 SMD1YGR074W 441 nt1.58□□□□□ -2.16
YPS3Q12303 YBL073WYBL073W 312 nt1.58□□□□□ -2.16
YPS3Q12303 IRC23YOR044W 474 nt1.58□□□□□ -2.16
YPS3Q12303 BIL1YOR304C-A 231 nt1.58□□□□□ -2.16
YPS3Q12303 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.58□□□□□ -2.16
YPS3Q12303 BUD2YKL092C 3315 nt1.58□□□□□ -2.16
YPS3Q12303 ATG9YDL149W 2994 nt1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.9 ms