Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 DBP7YKR024C 2229 nt2.58□□□□□ -2
MSL5Q12186 DOT6YER088C 2013 nt2.58□□□□□ -2
MSL5Q12186 MRP10YDL045W-A 288 nt2.58□□□□□ -2
MSL5Q12186 YDR209CYDR209C 414 nt2.58□□□□□ -2
MSL5Q12186 YGL217CYGL217C 342 nt2.58□□□□□ -2
MSL5Q12186 YBR224WYBR224W 516 nt2.58□□□□□ -2
MSL5Q12186 NCL1YBL024W 2055 nt2.57□□□□□ -2
MSL5Q12186 BOI1YBL085W 2943 nt2.57□□□□□ -2
MSL5Q12186 ERP6YGL002W 651 nt2.57□□□□□ -2
MSL5Q12186 snR43snR43 209 nt2.57□□□□□ -2
MSL5Q12186 SAP1YER047C 2694 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 TIM11YDR322C-A 291 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 YHL005CYHL005C 393 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 RRT15YLR162W-A 189 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 RPL38YLR325C 237 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 FPR1YNL135C 345 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 snR52snR52 92 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 PDE2YOR360C 1581 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 MDM1YML104C 3384 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 LRE1YCL051W 1752 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 RLF2YPR018W 1821 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 YDR239CYDR239C 2364 nt2.56□□□□□ -2
MSL5Q12186 YIL169CYIL169C 2988 nt2.55□□□□□ -2
MSL5Q12186 SRB8YCR081W 4284 nt2.55□□□□□ -2
MSL5Q12186 SSS1YDR086C 243 nt2.55□□□□□ -2
MSL5Q12186 YGL069CYGL069C 465 nt2.55□□□□□ -2
MSL5Q12186 RPL6AYML073C 531 nt2.55□□□□□ -2
MSL5Q12186 DFG16YOR030W 1860 nt2.55□□□□□ -2
MSL5Q12186 GEA1YJR031C 4227 nt2.55□□□□□ -2
MSL5Q12186 PRP8YHR165C 7242 nt2.55□□□□□ -2
MSL5Q12186 YBT1YLL048C 4986 nt2.54□□□□□ -2
MSL5Q12186 RTC6YPL183W-A 282 nt2.54□□□□□ -2
MSL5Q12186 GIN4YDR507C 3429 nt2.54□□□□□ -2
MSL5Q12186 CDC27YBL084C 2277 nt2.54□□□□□ -2
MSL5Q12186 ILS1YBL076C 3219 nt2.54□□□□□ -2
MSL5Q12186 PSO2YMR137C 1986 nt2.54□□□□□ -2
MSL5Q12186 ASG1YIL130W 2895 nt2.54□□□□□ -2 RIP-Chip
MSL5Q12186 LCD1YDR499W 2244 nt2.53□□□□□ -2
MSL5Q12186 INP52YNL106C 3552 nt2.53□□□□□ -2
MSL5Q12186 SSN2YDR443C 4263 nt2.53□□□□□ -2
MSL5Q12186 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt2.53□□□□□ -2
MSL5Q12186 VTC1YER072W 390 nt2.53□□□□□ -2
MSL5Q12186 RPS21AYKR057W 264 nt2.53□□□□□ -2
MSL5Q12186 YML037CYML037C 1023 nt2.53□□□□□ -2
MSL5Q12186 SEC5YDR166C 2916 nt2.52□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 SMD1YGR074W 441 nt2.52□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 YPR092WYPR092W 306 nt2.52□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.52□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.52□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 ISW1YBR245C 3390 nt2.52□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 GUP1YGL084C 1683 nt2.52□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 ALK2YBL009W 2031 nt2.52□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.51□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 ACM1YPL267W 630 nt2.51□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 NMD2YHR077C 3270 nt2.51□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 TOP2YNL088W 4287 nt2.51□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 SNT1YCR033W 3681 nt2.5□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 PDR3YBL005W 2931 nt2.5□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 MDM20YOL076W 2391 nt2.5□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 INA22YIR024C 651 nt2.5□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 PAN3YKL025C 2040 nt2.5□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 RRP12YPL012W 3687 nt2.49□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 DYN1YKR054C 12279 nt2.49□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 SWA2YDR320C 2007 nt2.49□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 YDR186CYDR186C 2634 nt2.49□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 KEL2YGR238C 2649 nt2.49□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 TRM2YKR056W 1920 nt2.49□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 TRX1YLR043C 312 nt2.49□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 YLR255CYLR255C 354 nt2.49□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 YOR376WYOR376W 369 nt2.49□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 LCL1YPL056C 306 nt2.49□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 YKU80YMR106C 1890 nt2.49□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 COS111YBR203W 2775 nt2.49□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 IPT1YDR072C 1584 nt2.49□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 PUF4YGL014W 2667 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 YJL070CYJL070C 2667 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 NEW1YPL226W 3591 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 SMY2YBR172C 2223 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 CFT2YLR115W 2580 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 RLI1YDR091C 1827 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 snR74snR74 88 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 HYP2YEL034W 474 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 SNC2YOR327C 348 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 NUT2YPR168W 474 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 SGD1YLR336C 2700 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 SGS1YMR190C 4344 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 TOF2YKR010C 2316 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 HSC82YMR186W 2118 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 SPT21YMR179W 2277 nt2.48□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 TMN3YER113C 2121 nt2.47□□□□□ -2.01
MSL5Q12186 BAS1YKR099W 2436 nt2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.6 ms