Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 SRO77YBL106C 3033 nt2.57□□□□□ -2
HFI1Q12060 TWF1YGR080W 999 nt2.57□□□□□ -2
HFI1Q12060 snR36snR36 182 nt2.57□□□□□ -2
HFI1Q12060 CRM1YGR218W 3255 nt2.57□□□□□ -2
HFI1Q12060 ARP8YOR141C 2646 nt2.57□□□□□ -2
HFI1Q12060 SCD5YOR329C 2619 nt2.57□□□□□ -2
HFI1Q12060 YBP1YBR216C 2025 nt2.57□□□□□ -2
HFI1Q12060 YDR239CYDR239C 2364 nt2.57□□□□□ -2
HFI1Q12060 MSB1YOR188W 3414 nt2.56□□□□□ -2
HFI1Q12060 SNF5YBR289W 2718 nt2.56□□□□□ -2
HFI1Q12060 YFL032WYFL032W 321 nt2.56□□□□□ -2
HFI1Q12060 YMR320WYMR320W 306 nt2.56□□□□□ -2
HFI1Q12060 SWR1YDR334W 4545 nt2.56□□□□□ -2
HFI1Q12060 RPS29AYLR388W 171 nt2.55□□□□□ -2
HFI1Q12060 NOT5YPR072W 1683 nt2.55□□□□□ -2
HFI1Q12060 VMA9YCL005W-A 222 nt2.55□□□□□ -2
HFI1Q12060 KEL2YGR238C 2649 nt2.55□□□□□ -2
HFI1Q12060 TOF2YKR010C 2316 nt2.54□□□□□ -2
HFI1Q12060 PAN3YKL025C 2040 nt2.54□□□□□ -2
HFI1Q12060 SMY1YKL079W 1971 nt2.54□□□□□ -2
HFI1Q12060 NUP120YKL057C 3114 nt2.54□□□□□ -2
HFI1Q12060 RBK1YCR036W 1002 nt2.54□□□□□ -2
HFI1Q12060 YGL069CYGL069C 465 nt2.54□□□□□ -2
HFI1Q12060 LCL1YPL056C 306 nt2.54□□□□□ -2
HFI1Q12060 TOP2YNL088W 4287 nt2.54□□□□□ -2
HFI1Q12060 PUT3YKL015W 2940 nt2.54□□□□□ -2
HFI1Q12060 FAR11YNL127W 2862 nt2.54□□□□□ -2
HFI1Q12060 PHS1YJL097W 654 nt2.53□□□□□ -2
HFI1Q12060 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.53□□□□□ -2
HFI1Q12060 YBR224WYBR224W 516 nt2.53□□□□□ -2
HFI1Q12060 CDC27YBL084C 2277 nt2.53□□□□□ -2
HFI1Q12060 YBR184WYBR184W 1572 nt2.53□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 LYS9YNR050C 1341 nt2.52□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 RPL39YJL189W 156 nt2.52□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 RPL32YBL092W 393 nt2.52□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 YLR149CYLR149C 2193 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 RKM1YPL208W 1752 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 ATG11YPR049C 3537 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 ALK2YBL009W 2031 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 SPO22YIL073C 2928 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 HYP2YEL034W 474 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 ACM1YPL267W 630 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 DFG16YOR030W 1860 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 PEP3YLR148W 2757 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 EDS1YBR033W 2760 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 CDC53YDL132W 2448 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 SGO1YOR073W 1773 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 SAP190YKR028W 3102 nt2.51□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 ISW1YBR245C 3390 nt2.5□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 SEC16YPL085W 6588 nt2.5□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 MNL2YLR057W 2550 nt2.5□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 TRS130YMR218C 3309 nt2.5□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.5□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 NUP100YKL068W 2880 nt2.5□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 SCH9YHR205W 2475 nt2.49□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 SEF1YBL066C 3447 nt2.49□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 snR65snR65 100 nt2.49□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 YIL059CYIL059C 366 nt2.49□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 SGM1YJR134C 2124 nt2.49□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 VMR1YHL035C 4779 nt2.49□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 YKU80YMR106C 1890 nt2.48□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 PAC1YOR269W 1485 nt2.48□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.48□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 FMP23YBR047W 528 nt2.48□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 VPS13YLL040C 9435 nt2.48□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 STE5YDR103W 2754 nt2.48□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 PSD2YGR170W 3417 nt2.48□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 STB4YMR019W 2850 nt2.47□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.47□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 RPA34YJL148W 702 nt2.47□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 DAD3YBR233W-A 285 nt2.47□□□□□ -2.01
HFI1Q12060 UBP15YMR304W 3693 nt2.46□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 UBR1YGR184C 5853 nt2.46□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.46□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 GUP1YGL084C 1683 nt2.46□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 PEX8YGR077C 1770 nt2.46□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 MGM1YOR211C 2646 nt2.45□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 SET2YJL168C 2202 nt2.45□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 TRA1YHR099W 11235 nt2.45□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 YCR022CYCR022C 345 nt2.45□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 ATP7YKL016C 525 nt2.45□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 PAU8YAL068C 363 nt2.45□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.45□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 PAU20YOL161C 363 nt2.45□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 ORC2YBR060C 1863 nt2.45□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 KRE33YNL132W 3171 nt2.45□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 VPH1YOR270C 2523 nt2.44□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 STH1YIL126W 4080 nt2.44□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 RPL35AYDL191W 363 nt2.44□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 YHL041WYHL041W 450 nt2.44□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 YBL083CYBL083C 426 nt2.44□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 YOR333CYOR333C 417 nt2.44□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 YEF3YLR249W 3135 nt2.44□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 CSN9YDR179C 489 nt2.43□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 YDR286CYDR286C 345 nt2.43□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.43□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 SSQ1YLR369W 1974 nt2.43□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 SLM1YIL105C 2061 nt2.42□□□□□ -2.02
HFI1Q12060 RPL42BYHR141C 321 nt2.42□□□□□ -2.02
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