Protein–RNA interactions for Protein: Q12018

CDC53, Cell division control protein 53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDC53Q12018 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.84□□□□□ -1.95
CDC53Q12018 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.84□□□□□ -1.95
CDC53Q12018 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.84□□□□□ -1.95
CDC53Q12018 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.84□□□□□ -1.95
CDC53Q12018 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.84□□□□□ -1.95
CDC53Q12018 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.84□□□□□ -1.95
CDC53Q12018 YIL174WYIL174W 228 nt2.84□□□□□ -1.95
CDC53Q12018 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.84□□□□□ -1.95
CDC53Q12018 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.84□□□□□ -1.95
CDC53Q12018 PEP3YLR148W 2757 nt2.84□□□□□ -1.95
CDC53Q12018 NOT5YPR072W 1683 nt2.84□□□□□ -1.95
CDC53Q12018 TMN3YER113C 2121 nt2.84□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 SGO1YOR073W 1773 nt2.84□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 PTP3YER075C 2787 nt2.83□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 STB4YMR019W 2850 nt2.83□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YIL059CYIL059C 366 nt2.83□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YMR320WYMR320W 306 nt2.83□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 HCH1YNL281W 462 nt2.83□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 RPL32YBL092W 393 nt2.83□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YBR224WYBR224W 516 nt2.83□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 snR43snR43 209 nt2.83□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 SRB8YCR081W 4284 nt2.83□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YBR184WYBR184W 1572 nt2.83□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 ZRG8YER033C 3231 nt2.82□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 PDR1YGL013C 3207 nt2.82□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 ALK2YBL009W 2031 nt2.82□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 INO80YGL150C 4470 nt2.82□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 RBK1YCR036W 1002 nt2.82□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 snR65snR65 100 nt2.82□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.82□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.82□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.82□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 DAD3YBR233W-A 285 nt2.82□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 SIR4YDR227W 4077 nt2.82□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 PDR3YBL005W 2931 nt2.82□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YKU80YMR106C 1890 nt2.82□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YFL032WYFL032W 321 nt2.81□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.81□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 PHS1YJL097W 654 nt2.81□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 HHT1YBR010W 411 nt2.81□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 snR36snR36 182 nt2.81□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 LYS9YNR050C 1341 nt2.81□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 GRR1YJR090C 3456 nt2.81□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 MNL2YLR057W 2550 nt2.8□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 RPA34YJL148W 702 nt2.8□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 STE5YDR103W 2754 nt2.8□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 SGS1YMR190C 4344 nt2.8□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 ORC2YBR060C 1863 nt2.79□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 SNF5YBR289W 2718 nt2.79□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 OSH6YKR003W 1347 nt2.79□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YDR008CYDR008C 351 nt2.79□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YDR209CYDR209C 414 nt2.79□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 PAU8YAL068C 363 nt2.79□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.79□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 PAU20YOL161C 363 nt2.79□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 SRO77YBL106C 3033 nt2.79□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 GUP1YGL084C 1683 nt2.79□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 TAR1YLR154W-C 375 nt2.78□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 YOR333CYOR333C 417 nt2.78□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 LCL1YPL056C 306 nt2.78□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 KEL2YGR238C 2649 nt2.78□□□□□ -1.96
CDC53Q12018 ESC1YMR219W 4977 nt2.77□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 SET2YJL168C 2202 nt2.77□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 PEX8YGR077C 1770 nt2.77□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 NEW1YPL226W 3591 nt2.76□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 EDS1YBR033W 2760 nt2.76□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 PAC1YOR269W 1485 nt2.76□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 MNE1YOR350C 1992 nt2.76□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 YPR097WYPR097W 3222 nt2.76□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 YFL063WYFL063W 456 nt2.75□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 RPS17AYML024W 411 nt2.75□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 SLM1YIL105C 2061 nt2.75□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 SSD1YDR293C 3753 nt2.75□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 REV3YPL167C 4515 nt2.74□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 GCN4YEL009C 846 nt2.74□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 YBL083CYBL083C 426 nt2.74□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 YDR239CYDR239C 2364 nt2.73□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 TDA9YML081W 3756 nt2.73□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 RTT107YHR154W 3213 nt2.73□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 RPL35AYDL191W 363 nt2.73□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 RPL38YLR325C 237 nt2.73□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 YNL114CYNL114C 372 nt2.73□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 VPH1YOR270C 2523 nt2.73□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 SMC6YLR383W 3345 nt2.73□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 RIM20YOR275C 1986 nt2.72□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 YCR043CYCR043C 384 nt2.72□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 CSN9YDR179C 489 nt2.72□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.72□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 STE11YLR362W 2154 nt2.72□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 ACM1YPL267W 630 nt2.72□□□□□ -1.97
CDC53Q12018 SIR3YLR442C 2937 nt2.71□□□□□ -1.98
CDC53Q12018 NUM1YDR150W 8247 nt2.71□□□□□ -1.98
CDC53Q12018 HYP2YEL034W 474 nt2.71□□□□□ -1.98
CDC53Q12018 YAR029WYAR029W 225 nt2.71□□□□□ -1.98
CDC53Q12018 HTB2YBL002W 396 nt2.71□□□□□ -1.98
CDC53Q12018 FKS3YMR306W 5358 nt2.71□□□□□ -1.98
CDC53Q12018 VTC3YPL019C 2508 nt2.7□□□□□ -1.98
CDC53Q12018 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.7□□□□□ -1.98
CDC53Q12018 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.7□□□□□ -1.98
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