Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFFO1Q0D2I5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms