Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms