Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLEQ07864 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLEQ07864 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLEQ07864 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLEQ07864 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLEQ07864 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLEQ07864 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLEQ07864 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLEQ07864 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLEQ07864 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLEQ07864 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLEQ07864 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLEQ07864 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POLEQ07864 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POLEQ07864 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms