Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KDSRQ06136 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KDSRQ06136 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms