Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN1Q04323 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms