Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP27A1Q02318 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP27A1Q02318 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms