Protein–RNA interactions for Protein: Q01329

PTA1, Pre-tRNA-processing protein PTA1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTA1Q01329 AIM9YER080W 1884 nt2.6□□□□□ -1.99
PTA1Q01329 NUP170YBL079W 4509 nt2.6□□□□□ -1.99
PTA1Q01329 NHP2YDL208W 471 nt2.59□□□□□ -1.99
PTA1Q01329 TIM13YGR181W 318 nt2.59□□□□□ -1.99
PTA1Q01329 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.59□□□□□ -1.99
PTA1Q01329 GIS1YDR096W 2685 nt2.59□□□□□ -2
PTA1Q01329 RRP6YOR001W 2202 nt2.58□□□□□ -2
PTA1Q01329 SOK2YMR016C 2358 nt2.58□□□□□ -2
PTA1Q01329 KAP123YER110C 3342 nt2.58□□□□□ -2
PTA1Q01329 TWF1YGR080W 999 nt2.58□□□□□ -2
PTA1Q01329 SNC1YAL030W 354 nt2.58□□□□□ -2
PTA1Q01329 YKL083WYKL083W 615 nt2.58□□□□□ -2
PTA1Q01329 AFI1YOR129C 2682 nt2.58□□□□□ -2
PTA1Q01329 MLH1YMR167W 2310 nt2.58□□□□□ -2
PTA1Q01329 UBP1YDL122W 2430 nt2.58□□□□□ -2
PTA1Q01329 CDC53YDL132W 2448 nt2.58□□□□□ -2
PTA1Q01329 DOT6YER088C 2013 nt2.58□□□□□ -2
PTA1Q01329 YDL152WYDL152W 366 nt2.57□□□□□ -2
PTA1Q01329 YRB1YDR002W 606 nt2.57□□□□□ -2
PTA1Q01329 YDR413CYDR413C 576 nt2.57□□□□□ -2
PTA1Q01329 YER097WYER097W 330 nt2.57□□□□□ -2
PTA1Q01329 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.57□□□□□ -2
PTA1Q01329 HCH1YNL281W 462 nt2.57□□□□□ -2
PTA1Q01329 SCD5YOR329C 2619 nt2.56□□□□□ -2
PTA1Q01329 YBP1YBR216C 2025 nt2.56□□□□□ -2
PTA1Q01329 TRS130YMR218C 3309 nt2.56□□□□□ -2
PTA1Q01329 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.56□□□□□ -2
PTA1Q01329 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.56□□□□□ -2
PTA1Q01329 YPL229WYPL229W 621 nt2.56□□□□□ -2
PTA1Q01329 PUT3YKL015W 2940 nt2.56□□□□□ -2
PTA1Q01329 YER181CYER181C 324 nt2.55□□□□□ -2
PTA1Q01329 YGL069CYGL069C 465 nt2.55□□□□□ -2
PTA1Q01329 SAP190YKR028W 3102 nt2.55□□□□□ -2
PTA1Q01329 RIC1YLR039C 3171 nt2.55□□□□□ -2
PTA1Q01329 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.55□□□□□ -2
PTA1Q01329 YMR320WYMR320W 306 nt2.55□□□□□ -2
PTA1Q01329 EDS1YBR033W 2760 nt2.55□□□□□ -2
PTA1Q01329 STB4YMR019W 2850 nt2.55□□□□□ -2
PTA1Q01329 CRM1YGR218W 3255 nt2.54□□□□□ -2
PTA1Q01329 MRP10YDL045W-A 288 nt2.54□□□□□ -2
PTA1Q01329 YFH1YDL120W 525 nt2.54□□□□□ -2
PTA1Q01329 HSK3YKL138C-A 210 nt2.54□□□□□ -2
PTA1Q01329 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.54□□□□□ -2
PTA1Q01329 CDC27YBL084C 2277 nt2.54□□□□□ -2
PTA1Q01329 YLR149CYLR149C 2193 nt2.54□□□□□ -2
PTA1Q01329 PAN3YKL025C 2040 nt2.54□□□□□ -2
PTA1Q01329 SSQ1YLR369W 1974 nt2.54□□□□□ -2
PTA1Q01329 LYS9YNR050C 1341 nt2.53□□□□□ -2
PTA1Q01329 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.53□□□□□ -2
PTA1Q01329 RPL32YBL092W 393 nt2.53□□□□□ -2
PTA1Q01329 GUP1YGL084C 1683 nt2.53□□□□□ -2
PTA1Q01329 CSF1YLR087C 8877 nt2.53□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 SPF1YEL031W 3648 nt2.53□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 TOF2YKR010C 2316 nt2.52□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 TIM9YEL020W-A 264 nt2.52□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.52□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 YBR224WYBR224W 516 nt2.52□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 VMA9YCL005W-A 222 nt2.52□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 NOT5YPR072W 1683 nt2.52□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 RKM1YPL208W 1752 nt2.51□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.51□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 ATP7YKL016C 525 nt2.51□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.51□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 FMP23YBR047W 528 nt2.51□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 YCL023CYCL023C 348 nt2.51□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 NUP100YKL068W 2880 nt2.51□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 RBK1YCR036W 1002 nt2.5□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.5□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 YFL032WYFL032W 321 nt2.5□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 PHS1YJL097W 654 nt2.5□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 snR36snR36 182 nt2.5□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 DAD3YBR233W-A 285 nt2.5□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 SGO1YOR073W 1773 nt2.5□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 VPS13YLL040C 9435 nt2.5□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 MGM1YOR211C 2646 nt2.49□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 RPS27AYKL156W 249 nt2.49□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 PAU8YAL068C 363 nt2.49□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 PAU20YOL161C 363 nt2.49□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 MET18YIL128W 3099 nt2.49□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 PEP3YLR148W 2757 nt2.49□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 TUS1YLR425W 3924 nt2.49□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 YEF3YLR249W 3135 nt2.48□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 SVL3YPL032C 2478 nt2.48□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 SEF1YBL066C 3447 nt2.48□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 YDR286CYDR286C 345 nt2.48□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 RPA34YJL148W 702 nt2.48□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.48□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 UBP15YMR304W 3693 nt2.47□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 SCH9YHR205W 2475 nt2.47□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 SMY1YKL079W 1971 nt2.47□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 PAC1YOR269W 1485 nt2.47□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 UBR1YGR184C 5853 nt2.47□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 BRP1YGL007W 378 nt2.47□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 RPL39YJL189W 156 nt2.47□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 YBR184WYBR184W 1572 nt2.47□□□□□ -2.01
PTA1Q01329 IRA2YOL081W 9240 nt2.46□□□□□ -2.02
PTA1Q01329 DFG16YOR030W 1860 nt2.46□□□□□ -2.02
PTA1Q01329 YDR008CYDR008C 351 nt2.46□□□□□ -2.02
PTA1Q01329 STE5YDR103W 2754 nt2.46□□□□□ -2.02
PTA1Q01329 IRR1YIL026C 3453 nt2.45□□□□□ -2.02
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