Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
VLDLRP98155 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms