Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HBBP68871 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HBBP68871 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HBBP68871 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HBBP68871 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HBBP68871 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HBBP68871 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HBBP68871 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HBBP68871 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HBBP68871 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms