Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCDC1P59894 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DCDC1P59894 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms