Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3BP58499 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms