Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROK1P58294 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROK1P58294 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROK1P58294 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROK1P58294 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROK1P58294 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROK1P58294 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROK1P58294 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PROK1P58294 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PROK1P58294 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PROK1P58294 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PROK1P58294 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PROK1P58294 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PROK1P58294 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PROK1P58294 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PROK1P58294 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PROK1P58294 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PROK1P58294 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PROK1P58294 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PROK1P58294 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PROK1P58294 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PROK1P58294 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms