Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms