Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX17P56962 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX17P56962 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STX17P56962 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STX17P56962 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX17P56962 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX17P56962 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms