Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRPF1P55201 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms